NAE抑制剂底物降解验证平台部署实操指南

作者:菠萝爱吃肉2026.11.13 03:33浏览量:0

简介:以NAE抑制剂Pevonedistat(MLN4924,IC50 4.7 nM)为工具分子,讲清泛素—蛋白酶体底物降解验证平台的搭建方法:母液与工作液的浓度单位换算规则、分级稀释的精度校验、细胞与移植瘤模型的可执行参数、通路—底物—表型三层读出,以及上线检查表、排错表与安全合规边界。附可复用计算脚本,帮你降低"泛素连接酶底物难抓"导致的返工率。

一、部署对象与目标

1.1 部署对象

本文部署的是一套以泛素—蛋白酶体系统(UPS)为研究对象的”底物降解验证平台”,核心工具分子为 NAE(NEDD8 激活酶)抑制剂 Pevonedistat(研究代号 MLN4924,货号以实际采购为准)。该化合物为强效、选择性 NAE 抑制剂,与 AMP 结构同源,借 AMP 在 NAE 催化反应中形成的紧密结合产物位点上占据酶活中心。

理化与生化参数(入库核验用):

项目 取值 用途
IC50 4.7 nM 生化活性基线,浓度梯度设计的锚点
CAS 号 905579-51-3 身份唯一性校验
分子式 C21H25N5O4S 检索与台账登记
分子量 443.52 质量—摩尔浓度换算
纯度 >98% 入库验收阈值
外观 白色至类白色结晶粉末 到货外观核验
DMSO 溶解度 ≥50 mg/mL(约 112.73 mM) 母液/给药液浓度上限
储存 粉末 −20℃ 长期;2–4℃ 短期暂存;溶液 −20℃ 六个月 有效期管理

1.2 部署目标

  1. 细胞水平读出通路阻断:cullin 家族蛋白 neddylation 修饰下降,CRL/SCF 型连接酶底物累积;
  2. 建立量效关系:体外得到剂量—时间矩阵,体内得到剂量依赖的抑瘤曲线;
  3. 流程可追溯:试剂批次、母液批号、实验记录、原始数据一一对应,结论可复核。

1.3 部署前必须弄清的三件事

(1)泛素连接酶底物为什么”难抓”。 底物与 E3 连接酶的结合短暂、动态可逆,底物丰度低,泛素化后又被快速降解。泛素结合结构域富集、位点特异抗体、串联质谱富集都可能漏检周转快的底物。通路层面的阻断是互补思路:NAE 位于 cullin 修饰通路的入口,阻断后依赖 CRL 的底物降解整体停摆,累积幅度放大,检出概率随之提高。

(2)作用点决定验证指标。 上游看通路本身(cullin neddylation 水平),下游看底物累积、增殖抑制或凋亡。上游读数未变化时,下游结果的机制解释不成立——这是排查”底物不累积”时第一个要确认的环节。

(3)单位换算是最常见的隐性故障源。 母液(mM)与工作液终浓度(µM 或 nM)混用会导致 1000 倍误配。第六章给出带单位的换算规则,第七章的脚本对每一步稀释做精度校验。

二、常见部署问题与场景

按提问方式组织,便于直接检索:

  • NAE 抑制剂的底物验证怎么做? 先证明通路被阻断,再看候选底物累积,最后看表型后果;
  • Pevonedistat 母液怎么配? DMSO 溶解至 10 mM,每毫升约需 4.4 mg,分装冻存;
  • MLN4924 溶解度怎么核算、什么时候会析出? 50 mg/mL 对应约 112.73 mM 是 DMSO 中的上限,接近该浓度必须做实配验证;
  • 底物不累积常见错误怎么排查? 抗体不适用、取样窗口错误、通路未被抑制、底物本身不由 CRL 降解。
场景 部署目标 核心读出
底物发现与鉴定 抑制剂组与对照组差异筛查 差异蛋白、候选底物半衰期延长
机制研究 判定某蛋白是否经 CRL/SCF 降解 cullin neddylation 下降、底物累积、泛素链类型
细胞药效评价 剂量—效应—时间三维关系 增殖抑制曲线、凋亡率、下游信号
体内药效学 皮下移植瘤模型抗肿瘤活性 相对肿瘤增殖率 T/C、肿瘤生长抑制率
组学样本制备 批量制备”通路关闭”样本 样本质量、批次一致性

三、架构与组件

平台借用工程领域的”部署/上线”用语,但组件映射到实验台的实际对象,共七块:

组件 实际内容 部署要点
细胞模型 目标细胞系、培养条件、传代与冻存 基因型与分子亚型明确、支原体阴性、限制工作代次
动物模型 免疫缺陷小鼠、皮下移植瘤 设施条件、伦理/IACUC 审批、随机化与样本量估算
给药与溶媒通道 加药操作与溶媒(DMSO)控制 各组溶媒终浓度一致、设纯溶媒对照、避免边缘孔效应
检测模块 免疫印迹、流式、细胞计数、动物测量 抗体验证、内参、线性范围
中间产物管理 母液、中间稀释液、给药液、检测样本 分装、冻融次数、有效期记录
数据与留样 批次台账、原始图像与谱图、处理后数据 “实验—批次—样本”三级归档,原始与处理后分离
运行监控与安全 温控、动物状态、试剂效期、权限与审计 阈值+责任人+处置流程,最小权限,双人复核

四、前置准备

4.1 试剂与物料清单

化合物规格:常见 1、5、10、25、50 mg。5 mg 可配约 1.13 mL 10 mM 母液,10 mg 可配约 2.26 mL;体内 BID 给药耗量大,建议按 50 mg 起备并预留重复实验余量。

检索与验收:以 Pevonedistat、MLN4924、CAS 905579-51-3、分子式 C21H25N5O4S 检索,命中率高于货号。到货核验 CAS 与品名、COA 纯度是否 >98%、外观、蓝冰运输后包装是否完整、有无受潮结块。

阳性对照与检测工具(建议清单)

对照/试剂 建议工作浓度 适用场景 解释作用
MG132(蛋白酶体抑制剂) 10 µM,4–8 h 细胞 证明检测体系能捕获底物累积
Bortezomib(蛋白酶体抑制剂) 50–100 nM,4–8 h 细胞 同上,浓度更低、窗口更清晰
Pevonedistat 梯度 1 nM–10 µM,3 倍梯度 细胞 剂量依赖读出
抗 NEDD8、Cullin-1、Cullin-3 按说明书 通路层 确认靶点被抑制
候选底物抗体 按说明书 底物层 累积判定
内参(如 GAPDH/β-actin/总蛋白染色) 按说明书 全层 归一化
DMSO(细胞培养级) 终浓度 ≤0.1%(v/v) 细胞 溶媒对照基础

其余:无菌溶剂与培养基血清、免疫印迹耗材、实验记录模板、分析脚本。

4.2 环境与设备

细胞培养(温控培养箱、生物安全柜、离心机、计数仪、显微镜、液氮罐);动物实验(IVC 笼具、电子天平、游标卡尺);分子检测(电泳转印、成像);设施(化学品柜、通风、医废与化学废液处置渠道)。

4.3 权限、审批与流程

准备项 要求
实验审批 细胞系来源合规证明;动物实验须完成伦理委员会/IACUC 审批与方案备案
账户权限 数据与仪器账号按角色分配,最小权限
化学品安全 获取 SDS,掌握毒性与防护要求
流程文档 SOP、批次记录模板、变更登记单

4.4 环境变量清单

配置项 示例取值 说明
compound_name Pevonedistat(MLN4924) 通用名登记
compound_cas 905579-51-3 唯一性校验
molecular_weight 443.52 换算基准
purity_min >98% 入库阈值
solubility_dmso ≥50 mg/mL(≈112.73 mM) 浓度上限依据
stock_conc 10 mM 母液默认浓度
storage_powder / short / solution −20℃ 三年 / 2–4℃ 两周 / −20℃ 六个月 有效期
shipping_condition 蓝冰 到货温控核验
dosing_regimen / dose_levels BID(每 12 h 一次)/ 30、60 mg/kg 体内方案(须有来源)

五、部署流程

基线确认 → 试剂入库 → 母液与工作液 → 细胞模型处理 → 体内给药配置 → 检测与采集 → 上线验证 → 开放使用。每步设检查点,任一步异常,后续数据失去归因能力。

Step 1 环境与基线确认

细胞复苏扩增、支原体检测阴性、STR 鉴定、限定工作代次;用溶媒对照与阳性对照预跑一轮,确定接种密度、处理时长与检测窗口;动物实验前完成成瘤率与生长曲线确认、随机化分组。基线不稳时,任何组间差异都无法归因于化合物。

Step 2 试剂入库与台账登记

按 4.1 核验 CAS、纯度报告、外观与温控;登记批次号、到货日期、规格、储存位置;录入有效期(粉末 −20℃ 三年;2–4℃ 最长两周,超期转入 −20℃ 或按过期处理);设置效期提醒。台账是异常读数回溯的基础。

Step 3 母液与工作液配制

通风橱内用 DMSO 配 10 mM 母液(每毫升约 4.4 mg,对应 4.4352 mg/mL);10 mM 远低于约 112.73 mM 的溶解度上限,室温可溶清;小体积分装冻存,避免反复冻融;工作液逐级稀释,并统一各组溶媒终浓度。体内给药液浓度更接近上限,必须做实配溶解度验证(见 7.4)。

Step 4 细胞模型处理(可执行参数)

细胞系示例:HCT-116、RKO(结直肠,CRL 依赖增殖、p27^Kip1/CDT1 累积读出清晰);MDA-MB-468(乳腺);SU-DHL-4、TMD8、HCC-1bl 类 DLBCL 细胞(ABC 型对 NAE 抑制更敏感)。是否适用必须由你自己的预实验确认,不要照抄他人细胞系结论。

接种密度:96 孔板 3,000–8,000 cells/well;6 孔板 2–3×10⁵ cells/well。贴壁 12–24 h 后加药。

浓度梯度:以 10 mM 母液为起点做 3 倍梯度,覆盖 1 nM–10 µM,8–9 个点;生化 IC50 为 4.7 nM,细胞 IC50 通常高于生化值,梯度下限不要设得过高。

处理时间窗:通路层(cullin neddylation 下降)2–6 h;底物层累积 4–24 h;表型层 48–72 h。

对照与溶媒:DMSO 终浓度 ≤0.1%(v/v),各组一致,含纯溶媒对照与阳性对照(MG132 10 µM 或 Bortezomib 50–100 nM)。

读数原则:终点读数须与机制一致。若检测底物累积,取样时间应早于细胞出现明显毒性,否则毒性造成的蛋白量变化会掩盖底物效应。

Step 5 体内给药方案配置(含来源与实验口径)

参考方案为 BID(每 12 h 一次),剂量梯度 30 mg/kg 与 60 mg/kg,给药液按动物当前体重折算注射体积。

数据引用规范:文献报道(Pevonedistat 在 ABC 与 GCB 型 DLBCL 皮下移植瘤模型中的临床前研究)显示,30 与 60 mg/kg 的 T/C 分别约为 0.36 与 0.15,60 mg/kg 组观察到肿瘤完全生长抑制。这些数值是转述的二手信息,正式方案前必须回查原文,核对以下口径:模型与细胞系、接种细胞数与成瘤时间、给药途径与给药液溶媒配比、每组样本量、肿瘤与体重测量频率、T/C 计算日与归一化基线、统计方法与显著性判定。若与内部预实验数据冲突,以自测数据为准并在方案中记录差异。

必需要素:随机化分组与初始瘤体积分层;每组建议 6–10 只;给药量 = 体重 × 剂量;注射体积上限(一般 ≤10 mL/kg);每日两次给药需评估装置稳定性与排班。

Step 6 检测与数据采集

层级 检测内容 对应结论
通路层 Cullin-1、Cullin-3 neddylation 下降 化合物确实到达靶点
底物层 候选底物累积、泛素链类型、蛋白质组差异 该底物受 CRL 通路调控
表型层 增殖、细胞周期、凋亡 通路阻断的功能后果

原始图像、扫描文件、流式数据、仪器导出文件即时归档并备份。

Step 7 上线验证与开放使用

第八节检查表全部通过后进入正式使用,同时冻结第一版配置快照作为比对基线。

六、配置说明

6.1 关键配置项与风险

配置项 作用 风险点
母液浓度 决定稀释倍数与溶媒终浓度 浓度过高析出;溶媒过高干扰细胞
储存温度与时长 决定试剂可用窗口 2–4℃ 超期、反复冻融、溶液常温久置
给药剂量与频次 决定体内暴露强度 高剂量下溶媒体积增加,耐受性下降
溶媒对照 区分化合物效应与溶媒效应 缺失则数据无法解释
检测窗口 决定能否看到底物累积 取样过晚叠加毒性混杂

6.2 质量与摩尔浓度换算

  • 母液:10 mM × 443.52 ÷ 1000 = 4.4352 mg/mL,即每毫升约 4.4 mg;
  • 溶解度:50 ÷ 443.52 × 1000 ≈ 112.73 mM;
  • 通式:质量浓度(mg/mL)= 摩尔浓度(mM)× 分子量 ÷ 1000。

6.3 药物处理终浓度换算(单位规则,务必按单位取公式)

设母液浓度 10 mM、体系终体积 V(mL)、目标终浓度 C:

  • C 以 µM 表示:所需母液体积 = V × C ÷ 10(µL)
  • C 以 nM 表示:所需母液体积 = V × C ÷ 10000(µL)

示例(V = 2 mL,目标 100 nM = 0.1 µM):2 × 0.1 ÷ 10 = 0.02 µL;用 nM 公式校验:2 × 100 ÷ 10000 = 0.02 µL,两者一致。0.02 µL 远超常规移液精度,必须分级稀释(见 7.2)。任何情况下先确认 C 的单位,再套公式——单位混用会直接产生 1000 倍浓度误差。

6.4 给药方案换算

体重 m(g)、剂量 D(mg/kg):单次给药量 = m × D ÷ 1000(mg);给药液浓度 ρ(mg/mL):单次注射体积 = m × D ÷ (1000 × ρ)(mL)。提高给药液浓度以减小注射体积时,必须同步核算 ρ 在实际溶媒体系中的溶解度与稳定性。

6.5 配置管理规范

参数与实验记录分离;批次号、母液批号、冻融次数随样本记录;每次变更留痕(内容、原因、操作人、时间);细胞实验、动物实验与分析环境共用同一份参数定义。

七、示例脚本(示意,需自行做单元测试)

7.1 母液配制

  1. MOLAR_MASS = 443.52 # g/mol
  2. STOCK_CONC_MM = 10.0 # 目标母液 mmol/L
  3. def prepare_stock(mass_mg: float, stock_mm: float = STOCK_CONC_MM):
  4. if mass_mg <= 0:
  5. return None
  6. max_mm = 50.0 / MOLAR_MASS * 1000 # DMSO 上限 ≈ 112.73 mM
  7. if stock_mm > max_mm:
  8. return None # 超出溶解度,拒绝配制
  9. return round(mass_mg / (stock_mm * MOLAR_MASS / 1000), 3) # mL
  10. # prepare_stock(10) -> 2.255 mL(与"每毫升约 4.4 mg"一致)
  11. # prepare_stock(1, 200) -> None

7.2 工作液分级稀释(含中间浓度与精度校验)

  1. def serial_dilution(stock_mm=10.0, target_um=0.1, final_volume_ml=2.0,
  2. min_transfer_ul=0.5, step_factor=10.0):
  3. """从母液逐级稀释到工作液。
  4. stock_mm: 母液浓度 mM;target_um: 目标终浓度 µM;
  5. final_volume_ml: 每步配制体积 mL;min_transfer_ul: 移液精度下限 µL。
  6. 任一步转移体积低于下限即报错。"""
  7. stock_um = stock_mm * 1000.0 # 10 mM -> 10000 µM
  8. if target_um <= 0 or target_um > stock_um:
  9. return {"error": "目标浓度必须落在 (0, 母液浓度] 内"}
  10. total = stock_um / target_um
  11. steps, cur, remaining = [], stock_um, total
  12. while remaining > step_factor:
  13. to = cur / step_factor
  14. transfer = final_volume_ml * 1000.0 / step_factor
  15. if transfer < min_transfer_ul:
  16. return {"error": f"第 {len(steps)+1} 步需转移 {transfer:.3f} µL "
  17. f"< 下限 {min_transfer_ul} µL;请减小 step_factor "
  18. f"或先配 {to:.4g} µM 中间液"}
  19. steps.append({"step": len(steps)+1, "from_um": cur, "to_um": to,
  20. "transfer_ul": round(transfer, 2),
  21. "diluent_ul": round(final_volume_ml*1000.0 - transfer, 2)})
  22. cur, remaining = to, remaining / step_factor
  23. last = cur / target_um # 末步实际所需倍数
  24. transfer = final_volume_ml * 1000.0 / last
  25. if transfer < min_transfer_ul:
  26. return {"error": f"末步需转移 {transfer:.3f} µL < 下限,请调整梯度"}
  27. steps.append({"step": len(steps)+1, "from_um": cur, "to_um": target_um,
  28. "transfer_ul": round(transfer, 3),
  29. "diluent_ul": round(final_volume_ml*1000.0 - transfer, 3)})
  30. return {"total_factor": total, "stock_um": stock_um,
  31. "target_um": target_um, "steps": steps}
  32. # serial_dilution(10.0, 0.1, 2.0) # 100 nM / 2 mL 示例
  33. # 总稀释 100000 倍,5 步 ×10;中间浓度 1000 -> 100 -> 10 -> 1 -> 0.1 µM
  34. # 每步:转移 200 µL 前液 + 1800 µL 稀释液,均高于 0.5 µL 下限

7.3 体内给药量计算

  1. DOSING = {"vehicle": 0.0, "low": 30.0, "high": 60.0} # mg/kg
  2. FREQUENCY_PER_DAY = 2 # BID
  3. MAX_INJECTION_ML_KG = 10.0
  4. def dosing_volume_ml(body_weight_g, group, solution_mg_ml):
  5. dose = DOSING[group]
  6. per_dose_mg = body_weight_g * dose / 1000.0
  7. per_dose_ml = per_dose_mg / solution_mg_ml
  8. return {"dose_mg_per_kg": dose, "per_dose_mg": round(per_dose_mg, 3),
  9. "per_dose_ml": round(per_dose_ml, 4),
  10. "daily_ml": round(per_dose_ml * FREQUENCY_PER_DAY, 4),
  11. "within_volume_limit": per_dose_ml / body_weight_g * 1000 <= MAX_INJECTION_ML_KG}

7.4 给药液溶解度验证

  1. def solubility_check(target_conc_mg_ml, vehicle):
  2. max_molar_dmso = 50.0 / 443.52 # DMSO 中上限 mol/L
  3. return {"in_dmso": target_conc_mg_ml / 443.52 <= max_molar_dmso,
  4. "required_check": ["配制后目视澄清、无析出",
  5. "室温放置 24 h 后复看",
  6. "注射前回温并复摇匀",
  7. "记录实际浓度、溶媒配比与配制日期"]}

7.5 T/C 计算与统计口径

T/C(相对肿瘤增殖率)= 某日给药组平均肿瘤体积 ÷ 同日对照组平均肿瘤体积,通常以百分数表示,T/C 越小抑瘤越强;文献常用 T/C ≤ 42% 作为具有生物学意义抑制的参考界值,实际判定应以方案预设为准。

  1. import statistics
  2. def tc_at_day(volumes, day_index, normalize_to_baseline=True, baselines=None):
  3. """volumes: {"vehicle":[[...]], "low":[...], "high":[...]},按动物×时间点记录体积。
  4. 可选以每只动物 D0/基线体积归一化后再取均值。"""
  5. def norm(group):
  6. vals = volumes[group]
  7. if normalize_to_baseline and baselines and group in baselines:
  8. b = baselines[group]
  9. return [v / b[i] if b[i] else None for i, v in enumerate(vals)]
  10. return vals
  11. control = [x for x in norm("vehicle")[day_index] if x is not None]
  12. base = statistics.mean(control)
  13. out = {}
  14. for g, vals in norm({k: v for k, v in volumes.items() if k != "vehicle"}).items() if False else {}:
  15. pass
  16. for g in volumes:
  17. if g == "vehicle":
  18. continue
  19. vals = [x for x in norm(g)[day_index] if x is not None]
  20. if vals and base:
  21. out[g] = round(statistics.mean(vals) / base, 3)
  22. return {"control_mean": round(base, 3), "tc": out}

配套口径:体积用游标卡尺每周测 2–3 次;剔除规则事先写入方案(初始体积偏离组均值 ±2SD、体重下降 >20%、提前死亡或溃瘍达终点者按方案剔除并注明);组间比较采用对数转换后 t 检验或 Mann–Whitney U 检验,重复测量数据用混合效应模型或两因素重复测量 ANOVA,α = 0.05,多重比较校正;每组样本量按预期效应量估算,建议 6–10 只。

7.6 分析流程(伪代码)

  1. 1 校验输入:样本清单、分组、批次号、检测平台标识
  2. 2 质控:剔除内参异常、缺失值超限的样本
  3. 3 归一化:对照组归零/归一,计算效应量与置信区间
  4. 4 统计:组间比较 + 多重比较校正
  5. 5 输出:结果表、图形、版本号、输入数据校验值
  6. 6 归档:原始数据只读,处理后数据与脚本版本绑定

八、上线验证

验证项 方法 参考标准
试剂身份 核对 CAS 与纯度报告 CAS 905579-51-3,纯度 >98%
母液溶解 配 10 mM 后目视 澄清无颗粒,必要时短暂超声或温浴助溶
溶解度边界 50 mg/mL(≈112.73 mM)上限测试 超过应稀释后使用
通路阻断 Cullin-1、Cullin-3 neddylation 剂量依赖下降
底物累积 候选底物 + 蛋白酶体抑制剂阳性对照 抑制剂组累积,且阳性对照可模拟
量效关系 多剂量多时间点 剂量依赖,无明显溶媒干扰
体内药效 肿瘤体积与体重监测 剂量依赖抑制,T/C 与统计口径符合方案
数据完整性 原始数据与归档比对 原始—处理—结论全链路可追溯
可重复性 独立重复实验 关键结论方向一致

任一项不通过,回到对应步骤定位原因,通过前不建议放大实验规模。

九、常见问题与排查

现象 可能原因 排查思路
母液浑浊或析出 浓度过高、温度过低、受潮 核对是否超约 112.73 mM;回温复看;检查粉末状态
工作液浓度与预期差 1000 倍 µM/nM 公式用错 用 6.3 两条公式交叉验算
细胞无明显反应 浓度/时间不足;细胞不依赖 CRL;母液降解 先查通路阻断读数;复核储存与冻融次数
底物未见累积 底物不由 CRL 降解;抗体不适用;取样窗口错误 用 MG132/Bortezomib 验证检测体系;扩展时间点
对照组与给药组同时”起效” 溶媒浓度过高 统一 DMSO 终浓度,加纯溶媒对照
动物体重明显下降 给药负担、制剂耐受性 结合临床观察与给药记录,评估剂量与频次
组间差异大 初始瘤体积不均、分组不均衡 随机化并按初始体积分层
重复实验不一致 代次漂移、批次差异、操作差异 锁定代次与批次,统一 SOP

十、运维与优化

稳定性:粉末 −20℃ 长期、2–4℃ 短期暂存、溶液 −20℃ 六个月、运输全程蓝冰;母液小体积分装;关键试剂留样以备复检。

监控告警:试剂(效期、库存)、环境(冰箱与培养箱温度、动物房参数)、状态(体重与临床观察)、数据(备份与容量),每类设阈值、责任人与处置流程。

性能优化:多剂量多时间点矩阵并统一板布局以减少孔间位置效应;批量样本用自动化液体处理;组学设技术重复;分析脚本参数化支持一键重跑。

安全与合规(明确边界)

  • 该化合物及本平台结果仅用于科研与非临床前研究,禁止用于人体或任何临床用药判断;
  • 动物实验须在伦理委员会/IACUC 批准方案与批准剂量范围内开展,遵循 3R 原则与人道终点,非批准用途不得实施;
  • 操作前查阅 SDS;佩戴合适手套(DMSO 会携带化合物透皮,须选用耐受手套并避免皮肤接触)、护目装备、实验服;粉末称量与溶解在通风橱内进行,避免粉尘吸入;
  • 废液、废弃粉末、动物组织按化学危害与生物危害分类处置,交由合规渠道处理;
  • 数据访问最小权限、审计日志保留、双人复核;人员培训与记录留存。

成本控制:体内 BID 给药耗量大,按 50 mg 规格备货可减少分装拆封;体外筛选用小规格,体内实验前批量备货;对长期未用留样设定清理规则。

版本与回滚:以”方案编号 + 批次号 + 日期”标识版本;更换试剂批次、调整给药方案、修改分析脚本均视为配置变更;保留上一版快照与对照数据,结果异常时先暂停并用上一版复现关键读数,定位后再推进。

十一、总结与来源核验清单

  • 部署对象:Pevonedistat(MLN4924),IC50 4.7 nM,从 NAE 入口切断 cullin neddylation,使 CRL/SCF 型连接酶失活,是应对”泛素连接酶底物难抓”的有效切入点。
  • 关键步骤:基线确认 → 试剂入库 → 母液(10 mM,每毫升约 4.4 mg)与工作液(10 mM 母液:µM 用 V×C÷10 µL,nM 用 V×C÷10000 µL)→ 细胞模型(明确细胞系、接种密度、1 nM–10 µM 梯度、2–72 h 时间窗、DMSO ≤0.1%)→ 体内给药(BID,30/60 mg/kg,样本量 6–10,T/C 与统计口径预设)→ 检测与归档 → 上线验证。
  • 验证方法:cullin neddylation 下降 → 底物累积 → 量效关系 → 体内 T/C 与生长抑制,逐层确认。
  • 运维重点:储存与效期、批次可追溯、监控告警、版本化与回滚、安全与合规边界。

来源与核验清单(正式方案前逐项确认出处)

待核验数据 核验方式
CAS 905579-51-3、分子式 C21H25N5O4S、分子量 443.52 供应商产品页 + COA
纯度 >98%、外观、运输条件 到货 COA 与实物核验
IC50 4.7 nM 原始酶学/生化文献,注意测定条件(底物、ATP 浓度、平台)
DMSO 溶解度 ≥50 mg/mL(≈112.73 mM) 供应商 SDS/产品说明,并自行实测
储存条件与有效期 SDS + 供应商稳定性数据
体内数据(ABC/GCB 型 DLBCL 移植瘤、30/60 mg/kg、T/C 约 0.36 与 0.15、60 mg/kg 完全生长抑制) 必须回查原始文献,核对模型、接种量、给药途径、测量频率、样本量与统计方法;转述值仅作方案设计的量级参考,实际结论以自测数据为准
细胞系敏感性 自建预实验数据,不依赖文献外推