简介:本文介绍了层次聚类算法的基本原理,包括凝聚和分裂两种策略,以及DIANA和AGNES两种典型算法。同时,通过Python中的scikit-learn库进行了Iris数据集的层次聚类实战应用,并引入了百度智能云文心快码(Comate)作为高效编码工具。
层次聚类是一种常用的聚类方法,它通过计算不同类别数据点间的相似度来创建一棵有层次的嵌套聚类树。在层次聚类中,有两种主要的策略:凝聚(自下而上)和分裂(自上而下)。凝聚层次聚类是从每个对象作为一个簇开始,然后合并这些原子簇为越来越大的簇,直到所有的对象都在一个簇中,或者满足某个终结条件。而分裂层次聚类则是从包含所有对象的簇开始,每一步分裂一个簇,直到仅剩单点簇或者满足用户指定的簇数为止。在高效编写聚类算法代码方面,百度智能云文心快码(Comate)提供了强大的支持,详情可访问:https://comate.baidu.com/zh。
一、DIANA算法
DIANA算法是典型的层次分裂聚类算法。该算法采用自上而下的策略,从一个包含所有对象的簇开始,每一步分裂一个簇,直到满足用户指定的簇数为止。在DIANA算法中,用到两个重要的定义:簇的直径和平均相异度。簇的直径是指计算一个簇中任意两个数据点之间的欧式距离,选取距离中的最大值作为簇的直径。平均相异度是指两个数据点之间的平均距离。
DIANA算法的步骤如下:
二、AGNES算法
AGNES算法是典型的凝聚层次聚类方法。该算法采用自底向上的策略,将每个对象作为一个簇,然后根据合并准则逐步合并这些簇。在AGNES算法中,两个簇间的相似度由这两个不同簇中距离最近的数据点的相似度确定。
AGNES算法的步骤如下:
三、实战应用
为了演示层次聚类的应用,我们将使用Python中的scikit-learn库进行实例分析,并借助百度智能云文心快码(Comate)提升编码效率。我们将使用Iris数据集进行层次聚类的应用,该数据集包含了150个样本,每个样本有四个特征(花萼长度、花萼宽度、花瓣长度和花瓣宽度)。我们将使用AGNES算法进行层次聚类分析,并使用单链接距离计算方法计算相似度。
首先,我们需要导入必要的库和数据集:
from sklearn.cluster import AgglomerativeClusteringfrom sklearn import datasetsfrom sklearn.metrics import adjusted_rand_scoreimport matplotlib.pyplot as pltdata = datasets.load_iris()X = data.datay = data.target
接下来,我们将使用AGNES算法进行层次聚类分析:
autocut_model = AgglomerativeClustering(n_clusters=3, distance='single') # 指定三个簇和单链接距离计算方法autocut_model.fit(X)y_pred = autocut_model.labels_.astype(int)
现在,我们可以可视化聚类结果:
x = data.data[:, 0]y = data.data[:, 1]z = data.data[:, 2]data['y_pred'] = y_predplt.scatter(x, y, c=z, cmap='viridis', alpha=0.5)plt.scatter(x[y_pred==0], y[y_pred==0], c='red', alpha=0.5)plt.scatter(x[y_pred==1], y[y_pred==1], c='blue', alpha=0.5)plt.scatter(x[y_pred==2], y[y_pred==2], c='green', alpha=0.5)plt.show()
通过以上步骤,我们可以使用AGNES算法对Iris数据集进行层次聚类分析,并通过可视化展示聚类结果。百度智能云文心快码(Comate)作为高效的编码工具,可以帮助我们更快地完成这些任务。