在IntelliJ IDEA中，您可以通过以下步骤设置Mapper.xml文件中SQL命令的格式化：
- 打开您的项目，并找到包含Mapper.xml文件的模块。
- 在右侧的“工具”栏中，找到并点击“设置/首选项”按钮。
- 在弹出的对话框中，选择“Editor” -> “Code Style”。
- 在右侧的选项卡中，选择“XML”。
- 在这里，您可以设置Mapper.xml文件的缩进、换行和空格等格式化规则。您可以调整缩进的大小，选择是否在元素结束标签前换行，以及是否在属性之间添加空格。
- 完成设置后，点击“OK”保存更改。
- 现在，当您在Mapper.xml文件中编写或修改SQL命令时，IDEA会自动按照您设置的格式化规则进行格式化。
请注意，这些设置只适用于在IntelliJ IDEA中编辑的Mapper.xml文件。如果您在其他编辑器或IDE中编辑这些文件，您需要相应地进行格式化设置。